Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF5Q9Y2D1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms