Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF13BQ9Y275 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF13BQ9Y275 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms