Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms