Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVW-1Q9UQF0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms