Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM35Q9UPQ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms