Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHF8Q9UPP1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF8Q9UPP1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms