Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms