Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPCN1Q9ULQ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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