Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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