Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms