Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX41Q9UJV9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX41Q9UJV9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms