Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIMS3Q9UJD0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms