Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNOT7Q9UIV1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT7Q9UIV1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms