Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNAL1Q9UBT7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNAL1Q9UBT7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms