Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPASTQ9UBP0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms