Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPZ2Q9P299 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ2Q9P299 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms