Protein–RNA interactions for Protein: Q9P202

WHRN, Whirlin, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHRNQ9P202 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WHRNQ9P202 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WHRNQ9P202 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms