Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms