Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms