Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP4Q9P0V3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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