Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXXC1Q9P0U4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms