Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP5Q9NZZ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms