Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIS18AQ9NYP9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms