Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms