Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAH9Q9NYC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms