Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A4Q9NY91 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms