Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms