Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD8Q9NX08 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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