Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT57Q9NWB7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT57Q9NWB7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT57Q9NWB7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms