Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms