Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
DDX18Q9NVP1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX18Q9NVP1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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