Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms