Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A7Q9NVC3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A7Q9NVC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms