Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMP3Q9NV31 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMP3Q9NV31 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms