Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBRD1Q9NUN5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms