Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 495.6 ms