Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMILIN3Q9NT22 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMILIN3Q9NT22 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms