Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms