Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBP3Q9NS15 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTBP3Q9NS15 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTBP3Q9NS15 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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