Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms