Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
DUOX2Q9NRD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DUOX2Q9NRD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms