Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC52A3Q9NQ40 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC52A3Q9NQ40 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC52A3Q9NQ40 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms