Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms