Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms