Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA4Q9HCM2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA4Q9HCM2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms