Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POPDC2Q9HBU9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms