Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIPAS39Q9H9C1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIPAS39Q9H9C1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms