Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAS3Q9H6U6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAS3Q9H6U6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms