Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RWDD1Q9H446 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RWDD1Q9H446 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms