Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP62CLQ9H1M0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms